EdPEx (Education Criteria for Performance Excellence) เป็นโครงการที่สำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา (สกอ.) นำมาเป็นเครื่องมือในการยกระดับคุณภาพการอุดมศึกษาไทย EdPEx  ได้รับการยอมรับในระดับสากลว่าเป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพในการพัฒนาองค์กรสู่ความเป็นเลิศ เป็นกรอบมาตรฐานเดียวกันกับ Thailand Quality Award (TQA)
โดยมีเกณฑ์ ดังกล่าว 7 หมวด ประกอบด้วย

• หมวด 1 การนำองค์กร
• หมวด 2 การวางแผนเชิงยุทธศาสตร์
• หมวด 3 การให้ความสำคัญกับผู้รับบริการและผู้มีส่วนร่วม
• หมวด 4 การวัดการวิเคราะห์และการจัดการความรู้
• หมวด 5 การมุ่งเน้นทรัพยากรบุคคล
• หมวด 6 การจัดการกระบวนการ
• หมวด 7 ผลลัพท์การดำเนินการ

ในจัดทำโครงการการเกณฑ์คุณภาพการศึกษาเพื่อการดำเนินการที่เป็นเลิศ  2552-2553 (EdPEx) สกอ. ได้เชิญมหาวิทยาลัยต่างๆ เข้าร่วมโครงการ 15 มหาวิทยาลัย และมหาวิทยาลัยนเรศวรได้เข้าร่วมโครงการครั้งนี้ด้วย โดยคณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยนเรศวร เป็นคณะนำร่อง

ทางคณะวิทยาศาสตร์  ได้มีการดำเนินการต่างๆ เพื่อจัดทำตามโครงการเกณฑ์คุณภาพการศึกษาเพื่อการดำเนินการที่เป็นเลิศ 2552 – 2553  ดังนี้

• ดำเนินการแต่งตั้งคณะกรรมการการดำเนินการโครงการพัฒนาการศึกษาเพื่อความเป็นเลิศ (EdPEx) ของคณะ
• ประชุมเตรียมความพร้อมการประกันคุณภาพการศึกษาเพื่อความเป็นเลิศ ในการจัดทำโครงร่างองค์กร

และทางคณะที่ปรึกษาโครงการพัฒนาการศึกษาเพื่อความเป็นเลิศ (EdPEx) ของคณะได้เข้าให้คำแนะนำเกี่ยวกับการจัดทำโครงร่างองค์กร ของคณะฯ ในวันที่ 8 ธันวาคม 2553โดยมีคณะที่ปรึกษาดังนี้

• ดร.นงลักษณ์             ปานเกิดดี
• ผศ.ดร.ปัทมา             ลี้วนิช
• อาจารย์จันทร์นา        สงวนรุ่งวงศ์
• ตัวแทนจากสกอ